V3S automaticky stahuje citace pro publikace s vyplněným kódem Scopus. Záznamy z databázích WoS a Scopus, které reprezentují stejnou citaci, se slučují (většinou automaticky) do skupiny. K 10. 3. 2022 bylo staženo 440 tisíc citací (k 24 tisícům publikací) z nichž se 310 tisíc automaticky propojilo s příslušným záznamem citace WoS. Pouze 2400 citací je navrženo k propojení uživatelem. Způsob práce s novým uživatelským rozhraním pro zobrazování, editaci, propojování a potvrzování citací je popsán v nápovědě V3S.